Η πολιτική ηγεσία της Γενικής Γραμματείας Αιγαίου και Νησιωτικής Πολιτικής σήμερα:
Βασίλειος Κικίλιας | Υπουργός Ναυτιλίας και Νησιωτικής Πολιτικής από 15/03/2025 μέχρι και σήμερα
Στέφανος Γκίκας | Υφυπουργός Ναυτιλίας και Νησιωτικής Πολιτικής 06/2024 μέχρι και σήμερα
Εμμανουήλ Κουτουλάκης | Γενικός Γραμματέας Αιγαίου και Νησιωτικής Πολιτικής από 28/04/2021 μέχρι και σήμερα